Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Prpf8Q99PV0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf8Q99PV0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms