Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trim12aQ99PQ1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Trim12aQ99PQ1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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Trim12aQ99PQ1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim12aQ99PQ1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms