Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rtn4Q99P72 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rtn4Q99P72 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms