Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vgll1Q99NC0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vgll1Q99NC0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms