Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mrpl43Q99N89 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mrpl43Q99N89 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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