Protein–RNA interactions for Protein: Q99N28

Cadm3, Cell adhesion molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cadm3Q99N28 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cadm3Q99N28 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cadm3Q99N28 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms