Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tdrd1Q99MV1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tdrd1Q99MV1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd1Q99MV1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd1Q99MV1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd1Q99MV1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd1Q99MV1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd1Q99MV1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd1Q99MV1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd1Q99MV1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd1Q99MV1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tdrd1Q99MV1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms