Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fars2Q99M01 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fars2Q99M01 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms