Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Chmp1b1Q99LU0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chmp1b1Q99LU0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms