Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sh3bp5lQ99LH9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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