Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmp1Q99KU0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmp1Q99KU0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms