Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp11Q99K46 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp11Q99K46 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp11Q99K46 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp11Q99K46 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp11Q99K46 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp11Q99K46 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Usp11Q99K46 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms