Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Klhl22Q99JN2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl22Q99JN2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms