Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms