Protein–RNA interactions for Protein: Q921I2

Klhdc4, Kelch domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc4Q921I2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhdc4Q921I2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhdc4Q921I2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhdc4Q921I2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhdc4Q921I2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhdc4Q921I2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhdc4Q921I2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhdc4Q921I2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhdc4Q921I2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhdc4Q921I2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Klhdc4Q921I2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Klhdc4Q921I2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Klhdc4Q921I2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Klhdc4Q921I2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms