Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx9Q91VH2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx9Q91VH2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms