Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHN8

Nudt16l1, Tudor-interacting repair regulator protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt16l1Q8VHN8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Nudt16l1Q8VHN8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nudt16l1Q8VHN8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms