Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppargc1bQ8VHJ7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppargc1bQ8VHJ7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms