Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt25Q8VCW2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Krt25Q8VCW2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Krt25Q8VCW2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms