Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ubxn4Q8VCH8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn4Q8VCH8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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