Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Trim29Q8R2Q0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Trim29Q8R2Q0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms