Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Hecw1Q8K4P8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hecw1Q8K4P8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms