Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm1Q8K377 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm1Q8K377 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms