Protein–RNA interactions for Protein: Q8K352

Sash3, SAM and SH3 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sash3Q8K352 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sash3Q8K352 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sash3Q8K352 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sash3Q8K352 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sash3Q8K352 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sash3Q8K352 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sash3Q8K352 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sash3Q8K352 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sash3Q8K352 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sash3Q8K352 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sash3Q8K352 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sash3Q8K352 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sash3Q8K352 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sash3Q8K352 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sash3Q8K352 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sash3Q8K352 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sash3Q8K352 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms