Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Polr1eQ8K202 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1eQ8K202 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms