Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nupl2Q8CIC2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nupl2Q8CIC2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms