Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Rab11fip3Q8CHD8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rab11fip3Q8CHD8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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