Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp27Q8CEG8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp27Q8CEG8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms