Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc38Q8CDN8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc38Q8CDN8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms