Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nrip1Q8CBD1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nrip1Q8CBD1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms