Protein–RNA interactions for Protein: Q8C753

Kiaa0556, Protein KIAA0556, mousemouse

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa0556Q8C753 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kiaa0556Q8C753 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kiaa0556Q8C753 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kiaa0556Q8C753 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kiaa0556Q8C753 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kiaa0556Q8C753 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Kiaa0556Q8C753 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kiaa0556Q8C753 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Kiaa0556Q8C753 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Kiaa0556Q8C753 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kiaa0556Q8C753 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Kiaa0556Q8C753 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kiaa0556Q8C753 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms