Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Y0

4930572O03Rik, RIKEN cDNA 4930572O03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930572O03RikQ8C5Y0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930572O03RikQ8C5Y0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930572O03RikQ8C5Y0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930572O03RikQ8C5Y0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930572O03RikQ8C5Y0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms