Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc90bQ8C3X2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc90bQ8C3X2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc90bQ8C3X2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc90bQ8C3X2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc90bQ8C3X2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc90bQ8C3X2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc90bQ8C3X2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc90bQ8C3X2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc90bQ8C3X2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc90bQ8C3X2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms