Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYM7

Rsph4a, Radial spoke head protein 4 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph4aQ8BYM7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rsph4aQ8BYM7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Rsph4aQ8BYM7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rsph4aQ8BYM7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms