Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Kdm4aQ8BW72 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm4aQ8BW72 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms