Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN0

Ccdc122, Coiled-coil domain-containing protein 122, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc122Q8BVN0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc122Q8BVN0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc122Q8BVN0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms