Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLD6

Ankrd55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd55Q8BLD6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ankrd55Q8BLD6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ankrd55Q8BLD6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ankrd55Q8BLD6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ankrd55Q8BLD6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ankrd55Q8BLD6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ankrd55Q8BLD6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ankrd55Q8BLD6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ankrd55Q8BLD6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ankrd55Q8BLD6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ankrd55Q8BLD6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ankrd55Q8BLD6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ankrd55Q8BLD6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ankrd55Q8BLD6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ankrd55Q8BLD6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ankrd55Q8BLD6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms