Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prune1Q8BIW1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prune1Q8BIW1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms