Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gabra5Q8BHJ7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms