Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Katnb1Q8BG40 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Katnb1Q8BG40 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms