Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sv2bQ8BG39 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sv2bQ8BG39 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sv2bQ8BG39 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms