Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc50Q810U5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc50Q810U5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms