Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smim19Q80ZU4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Smim19Q80ZU4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smim19Q80ZU4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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