Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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RubcnQ80U62 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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RubcnQ80U62 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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RubcnQ80U62 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RubcnQ80U62 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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RubcnQ80U62 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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RubcnQ80U62 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
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RubcnQ80U62 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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RubcnQ80U62 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RubcnQ80U62 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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