Protein–RNA interactions for Protein: Q80TV8

Clasp1, CLIP-associating protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clasp1Q80TV8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clasp1Q80TV8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Clasp1Q80TV8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Clasp1Q80TV8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Clasp1Q80TV8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clasp1Q80TV8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clasp1Q80TV8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clasp1Q80TV8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clasp1Q80TV8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clasp1Q80TV8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clasp1Q80TV8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clasp1Q80TV8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clasp1Q80TV8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clasp1Q80TV8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Clasp1Q80TV8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clasp1Q80TV8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clasp1Q80TV8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms