Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ube2q1Q7TSS2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms