Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dsg1cQ7TSF0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dsg1cQ7TSF0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dsg1cQ7TSF0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms