Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nphp3Q7TNH6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nphp3Q7TNH6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nphp3Q7TNH6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms