Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pdcl2Q78Y63 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms