Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GypcQ78HU7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GypcQ78HU7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GypcQ78HU7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GypcQ78HU7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GypcQ78HU7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GypcQ78HU7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GypcQ78HU7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GypcQ78HU7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GypcQ78HU7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GypcQ78HU7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GypcQ78HU7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
GypcQ78HU7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GypcQ78HU7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms